Si bien es poco probable que las verrugas anales se conviertan en cáncer anal, las personas que han tenido verrugas anales tienen más probabilidades de desarrollar cáncer anal. Esto se debe a que las personas infectadas con subtipos de VPH que causan verrugas anales y genitales también tienen más probabilidades de estar infectadas con subtipos de VPH que causan cáncer anal.
La infección por VPH es común y, en la mayoría de los casos, el cuerpo puede eliminar la infección por sí solo, pero en algunas personas la infección no desaparece y se vuelve crónica. La infección crónica, especialmente con los tipos de VPH de alto riesgo, puede causar ciertos tipos de cáncer con el tiempo, incluido el cáncer anal.