Mặc dù bản thân mụn cóc hậu môn không có khả năng phát triển thành ung thư hậu môn, nhưng những người đã từng bị mụn cóc hậu môn có nhiều khả năng bị ung thư hậu môn hơn. Điều này là do những người bị nhiễm các phân nhóm HPV gây ra mụn cóc hậu môn và sinh dục cũng có nhiều khả năng bị nhiễm các phân nhóm HPV gây ra ung thư hậu môn hơn.

Nhiễm trùng HPV là phổ biến và trong hầu hết các trường hợp, cơ thể có thể tự loại bỏ nhiễm trùng, nhưng ở một số người, nhiễm trùng không biến mất và trở thành mãn tính. Nhiễm trùng mãn tính, đặc biệt là với các loại HPV có nguy cơ cao, có thể gây ra một số loại ung thư theo thời gian, bao gồm cả ung thư hậu môn.

Hiện tại không có khuyến nghị quốc gia nào về việc sàng lọc ung thư hậu môn. Nếu bạn đang sống chung với HIV, thì nguy cơ ung thư hậu môn sẽ cao hơn và có thể cân nhắc xét nghiệm phết tế bào cổ tử cung hậu môn. Bạn nên trao đổi với bác sĩ chăm sóc sức khỏe để xác định xem xét nghiệm phết tế bào cổ tử cung hậu môn hay xét nghiệm sàng lọc khác có hữu ích cho bạn không.

Ngoài ra còn có một loại vắc-xin tuyệt vời bảo vệ chống lại 9 chủng HPV phổ biến nhất - bao gồm 4 chủng có nguy cơ cao và 5 chủng có thể gây ra mụn cóc. Khuyến cáo rằng tất cả nam giới và phụ nữ <26 tuổi nên tiêm vắc-xin này. Vì bạn có thể không bị nhiễm cả 9 chủng, nên vắc-xin vẫn có thể mang lại một số lợi ích cho bạn. Nếu bạn chưa được tiêm vắc-xin, bạn nên trao đổi với bác sĩ về việc tiêm tiêm phòng.