Habang ang mga anal warts mismo ay hindi malamang na maging anal cancer, ang mga taong nagkaroon ng anal warts ay mas malamang na magkaroon ng anal cancer. Ito ay dahil ang mga taong nahawaan ng mga subtype ng HPV na nagdudulot ng anal at genital warts ay mas malamang na mahawahan ng mga subtype ng HPV na nagdudulot ng anal cancer.
Ang impeksyon sa HPV ay karaniwan, at sa karamihan ng mga kaso, ang katawan ay maaaring alisin ang impeksyon sa sarili nitong, ngunit sa ilang mga tao ang impeksiyon ay hindi nawawala at nagiging talamak. Ang talamak na impeksyon, lalo na sa mga high-risk na uri ng HPV, ay maaaring magdulot ng ilang partikular na kanser sa paglipas ng panahon, kabilang ang anal cancer.